בשנת 1858, ברובע היהודי של בולוניה, פורצים חיילי האפיפיור לביתה של משפחת מורטארה בהוראת הקרדינל, כדי לקחת את אדגרדו בן ה-7. שנים קודם לכן הטבילה המטפלת את אדגרדו התינוק ללא ידיעת המשפחה וכעת הוא חייב לקבל חינוך קתולי. הוריו המיואשים מגייסים את דעת הקהל והקהילה היהודית העולמית במאבק לקבל חזרה את הילד, אבל הכנסייה מוכנה למאבק גם היא.